Khó khăn đầu tiên liên quan đến việc triển khai các biện pháp nhận biết khách hàng. Hiện nay, việc quy định khách hàng phải có tài khoản tại ngân hàng và liên kết ví với thẻ ngân hàng gây khó khăn cho một số khách hàng không có tài khoản tại ngân hàng, nhất là với những người ở khu vực nông thôn hay vùng sâu, vùng xa.

Hiệp hội Ngân hàng 4 điểm nghẽn trong hoạt động trung gian thanh toán.

Đối với khách hàng đã liên kết tài khoản/thẻ thì đều phải đăng ký dịch vụ Internetbanking hoặc Mobilebanking của ngân hàng.

Điểm thứ hai là khung khổ pháp lý về dịch vụ trung gian thanh toán và Fintech còn thiếu và chưa đồng bộ, phát sinh vướng mắc khi triển khai thực hiện.

Chẳng hạn như, ngoài Văn bản hợp nhất số 47 có quy định về hoạt động cung ứng ví điện tử thì hiện chưa có văn bản pháp luật điều chỉnh chi tiết nội dung này.

Ngoài ra, hành lang pháp lý chưa có các quy định tương ứng giúp cho trung gian thanh toán cung cấp dịch vụ cho một số mô hình đặc thù (vd: các tổ chức từ thiện…), mô hình này nhu cầu ngày càng gia tăng.

Lượng người dùng ví điện tử và các hình thức thanh toán trực tuyến ngày một gia tăng, song mức độ bao phủ còn thấp và tập trung phần lớn ở khu vực thành thị. Về hệ thống cơ sở hạ tầng, điểm chấp nhận thanh toán không tiền mặt tại vùng nông thôn còn ít. Nhiều hệ sinh thái được phát triển một cách tự phát và chưa có sự liên thông.

Một khó khăn nữa là cơ chế hợp tác, chia sẻ dữ liệu giữa các ngân hàng, các tổ chức tín dụng và các tổ chức trung gian thanh toán, Fintech… chưa rõ ràng, còn đang trong tình trạng khép kín, chưa thực sự mở.