Số thuế GTGT tại khâu NK được trừ trực tiếp vào giá bán. Ảnh: T.T

Bà Hương Vũ, Trưởng nhóm Công tác Thuế và Hải quan của VBF cho biết, theo Thông tư 38/2015/TT-BTC, khi doanh nghiệp (DN) chế xuất thanh lý nguyên vật liệu vào thị trường nội địa, phải làm thủ tục chuyển đổi mục đích sử dụng và nộp lại số thuế giá trị gia tăng (GTGT) khâu nhập khẩu (NK); DN nội địa mua hàng hóa đó không phải nộp thuế GTGT khâu NK. Quy định không hướng dẫn việc khấu trừ, hoàn thuế GTGT đã nộp khâu NK đối với DN chế xuất. Tuy nhiên, sau đó Bộ Tài chính có công văn hướng dẫn DN chế xuất không phải nộp lại số thuế GTGT khâu NK mà DN nội địa sẽ thực hiện thủ tục NK hàng hóa và nộp thuế GTGT khâu NK. Số thuế này sẽ được DN nội địa khai khấu trừ để xác định số thuế GTGT phải nộp tháng đó.

DN đặt câu hỏi, liệu có phải có sự không nhất quán trong hướng dẫn của Bộ Tài chính. “Điều này rất thuận tiện nhưng phát sinh việc một số DN trước khi có hướng dẫn nêu trên của Bộ Tài chính đã ứ đọng số thuế GTGT này, giờ không biết giải quyết hoàn thuế ở cơ quan hải quan hay cơ quan thuế nội địa”, bà Hương Vũ nói.

Phó Tổng cục trưởng Tổng cục Hải quan Hoàng Việt Cường đã giải đáp thắc mắc của DN. Theo ông, việc DN chế xuất bán thanh lý nguyên vật liệu cho DN nội địa đang được điều chỉnh tại khoản 5 điều 25 của Nghị định số 08/2015/NĐ-CP của Chính phủ quy định chi tiết và biện pháp thi hành Luật Hải quan về thủ tục hải quan, kiểm tra, giám sát, kiểm soát hải quan và quy định tại Điều 79 và Điều 86 Thông tư số 38/2015/TT-BTC của Bộ Tài chính quy định về thủ tục hải quan; kiểm tra, giám sát hải quan; thuế xuất khẩu, thuế NK và quản lý thuế đối với hàng hoá xuất khẩu, NK.

Theo ông Hoàng Việt Cường, nếu DN bán trong nội địa sẽ phải theo quy định của Nghị định số 08/2015/NĐ-CP. Khi chế xuất bán cho nội địa thì phải nộp thuế GTGT ở khâu NK tại thời điểm đăng ký tờ khai hàng bán cho DN nội địa. Đương nhiên, thuế GTGT phải nộp ở khâu này. Cùng với đó, khi bán cho nội địa thì liên hệ với cơ quan thuế nội địa cấp hóa đơn bán lẻ GTGT.

“Sử dụng hóa đơn GTGT lẻ để xuất bán máy móc thiết bị, được xác định bằng số thuế GTGT ghi trên hóa đơn bán lẻ trừ đi số thuế nộp ở khâu NK khi chuyển đổi. Hay nói cách khác là số thuế GTGT tại khâu NK sẽ được trừ trực tiếp vào giá bán, như vậy, rất thuận lợi cho các DN hiện nay ở khu chế xuất”, ông Hoàng Việt Cường nói.

Tuy nhiên, theo Phó Tổng cục trưởng Tổng cục Hải quan, đây mới là một cách lựa chọn, DN còn cách lựa chọn khác, đó là thực hiện theo quy định tại Điều 86 Thông tư số 38/2015/TT-BTC. Tức là, DN chế xuất và DN nội địa được chọn hình thức làm thủ tục theo XNK tại chỗ. DN chế xuất làm tờ khai xuất và không phải nộp thuế GTGT, còn DN nội địa khi làm tờ khai NK thì phải nộp GTGT và sau đó được hoàn theo quy định.

Như vậy, DN có thể lựa chọn một trong hai hình thức và đều đúng pháp luật./.

Minh Anh