Theo Tổng cục Hải quan, khoản 2 Điều 3 Nghị định 120/2016/NĐ-CP của Chính phủ quy định chi tiết và hướng dẫn thi hành một số điều của Luật Phí và Lệ phí có quy định: “Tổ chức thu phí, lệ phí thực hiện kê khai, nộp phí, lệ phí thu được như sau: Tổ chức thu lệ phí thực hiện nộp toàn bộ tiền lệ phí thu
được vào ngân sách nhà nước. Tổ chức thu lệ phí thực hiện kê khai, nộp lệ phí theo tháng, quyết toán lệ phí năm theo quy định của pháp luật quản lý thuế”. Ngoài ra, khoản 2 Điều 4, khoản 4 Điều 5 Thông tư 194/2016/TT-BTC của Bộ Tài chính quy định mức thu, chế độ thu, nộp phí hải quan và lệ phí ra, vào cảng hàng không, sân bay đối với chuyến bay của nước ngoài đến các cảng hang không Việt Nam nêu: “Phí hải quan: 50 USD/chuyến bay đến”... “Tổ chức thu phí, lệ phí nộp 100% số tiền phí, lệ phíthu được vào ngân sách nước (ngân sách trung ương) theo chương, mục, tiểu mục của mục lục ngân sách nhà nước”.
Điểm i khoản 5 Điều 7 Nghị định 126/2020/NĐ-CP của Chính phủ quy định chi tiết một số điều của Luật Quản lý thuế quy định: “Tổ chức được giao nhiệm vụ tổ chức thu phí, lệ phí theo quy định của pháp luật về phí, lệ phí thực hiện khai số tiền phí, lệ phí đã thu được với cơ quan thuế quản lý trực tiếp (trừ phí hải quan; lệ phí hàng hóa, hành lý, phương tiện vận tải quá cảnh)”.
Cũng theo Tổng cục Hải quan, tại khoản 3 Điều 156 Luật Ban hành văn bản quy phạm pháp luật quy định: “Trong trường hợp các văn bản quy phạm pháp luật do cùng một cơ quan ban hành có quy định khác nhau về cùng một vấn đề thì áp dụng quy định của văn bản quy phạm pháp luật ban hành sau”.
Theo đó, Tổng cục Hải quan đề nghị Cảng vụ hàng không Việt Nam nộp tiền lệ phí hải quan đối với chuyến bay nước ngoài đến Việt Nam vào ngân sách nhà nước tại Kho bạc Nhà nước theo quy định, cơ quan quản lý thu là cơ quan hải quan./.
